2007年，李睿珺独立执导个人第一部电影《夏至》，该片获得第9届希腊国际独立电影人电影节最佳影片特别奖，并入围了第37届鹿特丹国际电影节。 2010年，执导由马新春、张敏合作主演的剧情片《老驴头》，该片入围第13届法国多维尔亚洲电影节、第7届中国独立影像年度展大奖、第15届釜山国际电影节新浪潮单元。 2012年，执导改编自苏童同名小说的乡村片《告诉他们，我乘白鹤去了》，该片由马兴春、张敏合作主演，入围第69届威尼斯国际电影节地平线单元、法国文化部华语电影教材，李睿珺凭借该片获得巴西利亚国际电影节最佳导演奖、第5届中国电影导演协会年度青年导演奖。 2014年，自编自导由汤龙、郭嵩涛共同主演的剧情片《家在水草丰茂的地方》，该片获得第27届东京国际电影节主竞赛单元-东京电影节大奖提名，李睿珺凭借该片获得第1届柏林华语电影节最佳编剧奖、第18届北京影视春燕奖最佳新人奖。同年，与杜波、易小星、王大庆等联合执导亲子公益片《有一天》，该片由9个温暖励志的小故事组成，讲述了9个弱势儿童群体追梦的故事，获得第6届澳门国际电影节最佳公益影片奖、第9届美国西雅图儿童电影节全球聚焦奖。 2017年，自编自导由杨子珊、尹昉合作主演的剧情片《路过未来》，该片获得第70届戛纳国际电影节一种关注单元大奖提名。2020年，担任编剧的电影《隐入尘烟》立项。2021年，担任第5届平遥国际电影展“平遥一角”的评委。 2022年1月，李睿珺编剧并执导，武仁林、海清主演的电影《隐入尘烟》入围第72届柏林国际电影节主竞赛单元。